MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD07

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010504	GAC	2	6	18	23	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010504	TGG	2	6	87	92	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010504	GTC	2	6	106	111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010504	GGC	2	6	169	174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010504	GGT	2	6	220	225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010504	CGGA	2	8	281	288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010504	CGA	2	6	315	320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010504	CGA	2	6	405	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010504	CGG	2	6	414	419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010504	TCT	2	6	469	474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010504	ACG	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010504	CGG	2	6	492	497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010504	GGC	2	6	502	507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010504	CGG	2	6	744	749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010504	AATT	2	8	755	762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010504	TCAAC	2	10	794	803	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010504	TGC	2	6	1404	1409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010504	CGA	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010504	GCC	2	6	1508	1513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010504	GC	3	6	1571	1576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010504	T	6	6	1652	1657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010504	CGT	2	6	1706	1711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010504	CCT	2	6	1766	1771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010504	GGC	2	6	1844	1849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010504	GGCC	2	8	1908	1915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010504	CCCCG	2	10	2015	2024	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_010504	CGGGG	2	10	2034	2043	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010504	GCC	2	6	2081	2086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010504	GCC	2	6	2157	2162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010504	GCC	2	6	2197	2202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010504	GCCC	2	8	2232	2239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_010504	CAG	2	6	2270	2275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010504	GCT	2	6	2284	2289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010504	CCT	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010504	CGA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010504	GCT	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010504	TGATCG	2	12	3743	3754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010504	GATC	2	8	3768	3775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010504	TTCAAT	2	12	3838	3849	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010504	TGG	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010504	GCC	2	6	4116	4121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010504	TC	3	6	4122	4127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010504	TGAA	2	8	4182	4189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010504	TGAT	2	8	4224	4231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010504	GATCC	2	10	4317	4326	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010504	GGGA	2	8	4443	4450	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010504	TCC	2	6	4456	4461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010504	TCG	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010504	AAG	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010504	GC	4	8	4599	4606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010504	TAC	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010504	GC	4	8	4622	4629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010504	CG	4	8	4776	4783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010504	GC	3	6	4882	4887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010504	GC	3	6	4945	4950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010504	GGCGCG	2	12	4977	4988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010504	TCTT	2	8	4991	4998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010504	GGGC	2	8	5103	5110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010504	C	6	6	6093	6098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_010504	GAAA	2	8	6166	6173	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010504	GTCT	2	8	6194	6201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010504	GTT	2	6	11228	11233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010504	CAG	2	6	11312	11317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010504	TGT	2	6	11983	11988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010504	CATGT	2	10	12478	12487	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010504	CCG	2	6	12534	12539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010504	GAC	2	6	12601	12606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010504	ATC	2	6	12644	12649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010504	GCT	2	6	12657	12662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010504	CGT	2	6	12673	12678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010504	CGC	2	6	12689	12694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010504	CCA	2	6	12715	12720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010504	CGC	3	9	12741	12749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010504	TTC	2	6	12754	12759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010504	CTC	2	6	13253	13258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010504	AGC	2	6	13289	13294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010504	CCT	2	6	15121	15126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_010504	GC	3	6	15138	15143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010504	GCCG	2	8	15178	15185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010504	ACCG	2	8	15248	15255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010504	GCC	2	6	15438	15443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010504	GGA	2	6	16317	16322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010504	ACG	2	6	16334	16339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010504	GCTG	2	8	16347	16354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010504	CAT	2	6	16404	16409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010504	TGC	2	6	16416	16421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010504	GGC	2	6	16429	16434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010504	CCA	2	6	16460	16465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010504	GCG	2	6	16492	16497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010504	TGT	2	6	16535	16540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010504	GCCGA	2	10	16672	16681	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_010504	GAG	2	6	16712	16717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010504	CTT	2	6	17882	17887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010504	CGG	2	6	17920	17925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010504	GCG	2	6	17945	17950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010504	TGC	2	6	17953	17958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010504	GCCT	2	8	17977	17984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010504	GCC	2	6	18856	18861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_010504	GCG	2	6	18885	18890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010504	CGC	2	6	18926	18931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010504	GTG	2	6	19531	19536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010504	TGG	2	6	19590	19595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010504	CG	3	6	19647	19652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010504	CT	3	6	21085	21090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010504	CG	3	6	21130	21135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010504	TACG	2	8	21162	21169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010504	TCTG	2	8	21216	21223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010504	GGC	2	6	21253	21258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.